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DOP-PCR试剂盒重点操作步骤,一定要看
浏览次数:575发布日期:2020-03-18
  DOP-PCR即Degenerated Oligonucleotide Primed PCR(简并寡核苷酸引物聚合酶链反应),它与普通PCR的区别在于其使用单一的半简并引物和低复性温度,半简并引物由特定序列+简并序列+特定序列三部分组成,因此没有种属特异性,也跟DNA的复杂性无关,能均匀地扩增真个基因组,尤其适用于痕量DNA样品的扩增。
 
  产品及特点
 
  本产品可用于不经过E.coli 培养和质粒提取而直接从转化子中筛选重组子,其原理是直接利用E.coli 菌落作为PCR模板,以识别载体质粒或/和插入片段顺序的寡核苷酸为引物对重组子进行筛查,通过PCR产物的有无和片段的大小来判断外源DNA片段是否被成功克隆到载体质粒之中,使用本产品可以使质粒鉴定过程从两天缩短到几小时。
 
  1. 简单快速,用户只需要提供PCR引物和E.coli 菌落,不需要培养和质粒提取,整个筛选过程从一天缩短到2-3小时,节约时间和成本。本产品与常用E.coli 菌株和载体兼容。既可小规模筛选,也适用于大规模筛查。
 
  2. 高灵敏度,既可用于高拷贝质粒,也适合于低拷贝质粒。
 
  3. 高特异性,本产品采用了十分有效的办法控制了培养基上残留质粒对PCR的影响,使假阳性率低于5%,而绝大部分同类产品的十分容易出现假阳性。
 
  4. PCR反应体系中含有惰性电泳染料,反映完成后可直接上样电泳,不需另加上样液。
 
  5. 处理过的菌落样品低温长期保存后仍能用于PCR筛查。
 
  6. 性价比高,价格更质粒提取试剂相当,但节约一天时间。
 
  DOP-PCR试剂盒操作步骤:
 
  (一)获得目的基因
 
  1、通过PCR方法:以含目的基因的克隆质粒为模板,按基因序列设计一对引物(在上游和下游引物分别引入不同的酶切位点),PCR循环获得所需基因片段。
 
  2、通过RT-PCR方法:用TRIzol法从细胞或组织中提取总RNA,以mRNA为模板,逆转录形成cDNA第一链,以逆转录产物为模板进行PCR循环获得产物。
 
  (二)构建重组表达载体
 
  1、DOP-PCR试剂盒(DOP-PCR Kit)载体酶切:将表达质粒用限制性内切酶(同引物的酶切位点)进行双酶切,酶切产物行琼脂糖电泳后,用胶回收Kit或冻融法回收载体大片段。
 
  2、PCR产物双酶切后回收,在T4DNA连接酶作用下连接入载体。
 
  (三)获得含重组表达质粒的表达菌种
 
  1、 将连接产物转化大肠杆菌DH5α,根据重组载体的标志(抗Amp或蓝白斑)作筛选,挑取单斑,碱裂解法小量抽提质粒,双酶切初步鉴定。
 
  2、 测序验证目的基因的插入方向及阅读框架均正确,进入下步操作。否则应筛选更多克隆,重复亚克隆或亚克隆至不同酶切位点。
 
  3、 以此重组质粒DNA转化表达宿主菌的感受态细胞。
 
  (四)诱导表达
 
  1、DOP-PCR试剂盒(DOP-PCR Kit)挑取含重组质粒的菌体单斑至2ml LB(含Amp50μg/ml)中37℃过夜培养。
 
  2、按1∶50比例稀释过夜菌,一般将1ml菌加入到含50mlLB培养基的300ml培养瓶中, 37℃震荡培养至OD600≌0.4-1.0(*0.6,大约需3hr)。
 
  3、取部分液体作为未诱导的对照组,余下的加入IPTG诱导剂至终浓度0.4mM作为实验组,两组继续37℃震荡培养3hr。
 
  4、分别取菌体1ml, 离心12000g×30s收获沉淀,用100μl 1%SDS重悬,混匀, 70℃10min。
 
  5、离心12000g×1min,取上清作为样品,可做SDS-PAGE等分析。